如果只把有用的基因拼接起来，会变成什么样？

“基因”是什么本身就是一个很头疼的问题，“有用”是什么本身又是一个很头疼的问题即便我们把所有与转录、翻译相关的元件（从启动子到终止子，再加上所有反式调控元件什么的甚至我们怀疑有特定作用但不知道有什么作用的序列）都算作“有用的基因”，删去其余序列还是会有很大问题。至少我们确信，那些“垃圾”序列是有做“必须序列”缓冲的作用的。以酿酒酵母为例，酵母有6000多个基因，其中只有不足2000个是“必须基因”，即（在现有研究范围内）无论如何也不能被删去的基因。而必须基因和非必须基因在整个基因组中是均匀分布的，并不会出现很重要的基因高度富集的情况。这就保证了在基因组在一个区域发生结构变异时，必须基因不会因为“挤在一起”而发生大规模的崩坏，使物种进入灭绝漩涡。高等生物中“垃圾序列”比例很高的道理也是一样的，一方面里面含有各种各样的不为我们所熟知的调控元件，另一方面，他们的存在也可视为“遗传稳定性元件”，即便其存在的序列信息可能并不如“有用的基因”那么重要，但他们的长短、分布对整个基因组的稳定，依然起着重要的作用。SC #2.0课题（SC是酿酒酵母拉丁名的首字母）旨在通过人工合成酿酒酵母的全基因组，并在非必须基因两翼加上synLoxP/CRE同源重组位点，来实现酿酒酵母的人工随机进化。但可以想见的是，在自然选择中进化的基因组，其在多变的环境下的适应性和鲁棒性，必然会好于人工删改的基因组。