有个同事请了三个月假培训他自己的副业，请假条流程就是分管领导和管委会主任轮流签字。

你算不上被当枪使！！只要请假条上有人签字，那就基本符合程序。如果请假条上无人签字，那请假条则无效。剩下的事，就是按正常的规定办理了。这个请假人在请假条没有生效的前提下，就自行离开工作岗位，这是他自己的错。如果被除名，这也是他自己的错。他把假条放在你这里，并不能规避他的错，也不能证明你的错，更不能证明办公室有错。你可以建议他去法院打行政诉讼官司，然后，由法院决定他的诉求。