2019年12月29日,武汉市卫健委首次报告了武汉市集中性肺炎病例的发生;2020年1月10日至今,共有6组武汉新型冠状病毒基因组序列发布。研究者们将武汉新型冠状病毒序列与已知感染人类的冠状病毒,即SARS和中东呼吸综合症(MERS)进行了比较。6个武汉新型冠状病毒序列几乎完全一致,其与SARS的同源性更高,相似性约为70%,与MERS相似性约为40%。序列差异主要在ORF1a和编码S-蛋白的spike基因上,这是冠状病毒与宿主细胞作用的关键蛋白。武汉新型冠状病毒与SARS及SARS样冠状病毒群在进化上非常亲密,拥有共同的外类群,可以推断它们的共同祖先是一类寄生于蝙蝠的冠状病毒。因此研究者推测武汉新型冠状病毒的原生宿主为蝙蝠,不过从蝙蝠到人可能还存在更多的中间宿主。